來自清華大學等機構的科學家在新冠病毒中發(fā)現(xiàn)了一種生物界全新的RNA加帽機制,北京時間10月5日凌晨,有關這一發(fā)現(xiàn)的論文由國際頂級學術期刊《細胞》(Cell)在線發(fā)表。
這一發(fā)現(xiàn)不僅是對病毒生命過程理解的重要更新,也是在生物學領域中第一次發(fā)現(xiàn)以蛋白質(zhì)為媒介來介導的RNA加帽過程,拓展了生命科學中對核酸加工的認識邊界。
在論文中,研究團隊還闡明了核苷類抗病毒藥物抑制這一過程的分子機制,提出了全新的“induce-and-lock”(誘導-封閉)的藥物設計機制。
這項成果是由清華大學教授饒子和、婁智勇團隊與廣州實驗室、上?萍即髮W等機構合作完成的。2003年以來,該團隊一直致力于冠狀病毒轉錄復制機制的研究。2020年新冠疫情暴發(fā)以來,該團隊先后在《自然》、《科學》、《細胞》等頂級期刊發(fā)表系列論文,為認識病毒的生命過程、研發(fā)抗病毒藥物提供了關鍵信息,是國際上新冠病毒轉錄復制研究中最為系統(tǒng)、被引用最多的研究成果之一,曾入選“2021年度中國科學十大進展”。
此次發(fā)現(xiàn)的RNA加帽途徑,是該團隊又一項重要的系統(tǒng)性工作。帽結構在細胞中廣泛存在,在細胞生命活動中發(fā)揮著關鍵功能。在高等生物細胞中,帽結構可以維持mRNA的穩(wěn)定性,防止核酸酶對mRNA的破壞,并可通過帽結合蛋白參與mRNA與核糖體的識別,調(diào)控蛋白質(zhì)翻譯的順利進行。病毒會通過宿主或病毒自身編碼的蛋白質(zhì),對病毒mRNA進行加帽,其結構與細胞中的帽結構完全相同,可以使宿主將病毒mRNA“誤認為”是宿主核酸分子,從而逃逸宿主天然免疫的攻擊。
新冠病毒是已知RNA病毒中基因組最大的一種病毒。在病毒學傳統(tǒng)認知中,冠狀病毒核酸的加帽通過四步反應過程完成?茖W家們此次發(fā)現(xiàn),新冠病毒能夠利用其轉錄復制復合體中的單鏈核酸結合蛋白nsp9作為媒介來加帽,該過程分為兩個階段。
研究團隊還發(fā)現(xiàn),核苷類抗病毒藥物能夠被聚合酶NiRAN結構域,通過類似的機制共價連接到nsp9蛋白,進而阻止加帽反應過程。尤其特殊的是,當核苷類抗病毒藥物索非布韋連接到nsp9蛋白后,藥物分子結合在一個被稱之為“Nuc口袋”的位點,并通過其核糖基團上的化學修飾,誘導NiRAN結構的“S-loop”發(fā)生劇烈的構象改變,封閉“G口袋”中GTP分子進出的路徑。這一發(fā)現(xiàn),不但為認識核苷類抗病毒藥物的作用機制提供了全新視角,還展示了一種“induce-and-lock”的全新藥物設計機制,為進一步發(fā)展高親和力、全新的抗病毒藥物提供了一個全新的角度。
這篇論文的共同通訊作者為清華大學饒子和、婁智勇教授和上?萍即髮W高巖博士。清華大學閆利明博士、黃羽岑博士生、葛基博士、劉震宇博士生為共同第一作者,研究工作得到上?萍即髮W和清華大學冷凍電鏡平臺的重要支持,受到國家自然科學基金、國家重點研發(fā)計劃、清華大學春風基金的資助。
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