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電子細(xì)胞和模擬細(xì)胞
2012/8/1  閱讀數(shù):


        據(jù)m.x4y7.cn小編了解,人工細(xì)胞計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)和虛擬細(xì)胞,或許將會(huì)為人類的生命研究、疾病研究以及新藥物的開發(fā)帶來一種新的強(qiáng)有力的工具。就像常規(guī)的工程制造項(xiàng)目,制造一個(gè)最優(yōu)化的人工細(xì)胞,利用計(jì)算機(jī)進(jìn)行模擬設(shè)計(jì)藍(lán)圖是必要的一個(gè)步驟。如今的生物學(xué)研究,已經(jīng)從描述性逐步走向了定量化的發(fā)展趨勢(shì),生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)等學(xué)科能夠?qū)⑸顒?dòng)信息化和數(shù)字化,以一種全方位的角度模擬和詮釋生命活動(dòng)的動(dòng)態(tài)過程。

        慶應(yīng)大學(xué)富田勝教授同venter實(shí)驗(yàn)室合作,利用支原體測(cè)序和基因組分析的數(shù)據(jù),開發(fā)出了e-cell,即電子細(xì)胞。這個(gè)軟件包是包含了一百二十七個(gè)必需基因的計(jì)算機(jī)細(xì)胞模型。這個(gè)高度簡化的virtual cell 能夠進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯,利用糖酵解途徑獲取能量,從細(xì)胞外吸收脂肪酸和甘油合成磷脂以合成細(xì)胞膜,不過其不能進(jìn)行繁殖和進(jìn)化。隨后,他們又相繼建立了紅血球細(xì)胞和線粒體等的模型。

        大腸桿菌作為最典型的微生物模式生物,其研究十分深入,我們能夠找到其豐富的生理生化和代謝物定量數(shù)據(jù),同時(shí)對(duì)其代謝網(wǎng)絡(luò)和代謝物流束的分析和模擬有了較長的研究歷史。福田實(shí)驗(yàn)室計(jì)劃利用現(xiàn)有的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)以及進(jìn)行大量的分析測(cè)試收集其轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)以及代謝組學(xué)等相關(guān)知識(shí),構(gòu)建出模擬細(xì)胞。同時(shí)很多其他的研究機(jī)構(gòu)也開始了相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)研究,以便于在這個(gè)領(lǐng)域有所突破,這對(duì)于人類新藥的開發(fā)也有著重要的推動(dòng)作用。

    編輯:山西:小張

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